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Enregistrement W2256506959 · doi:10.1080/07060661.2015.1065437

The Zn(II)2Cys6 putative transcription factor is involved in the regulation of leucinostatin production and pathogenicity of the nematophagous fungus <i>Paecilomyces lilacinus</i>

2015· article· en· W2256506959 sur OpenAlexvenueno aff
Fan Yang, Hazem Abdelnabby, Yannong Xiao

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPaecilomycesBiologyGeneEntomopathogenic fungusFungusMicrobiologyTranscription (linguistics)Transcription factorGeneticsBotanyBiological pest control

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zn(II)2Cys6 transcription factor genes encode transcription regulators that manage the infection potential and production of secondary metabolites such as toxins in fungi. In this study, a gene named rolP that encodes a putative Zn(II)2Cys6 transcription factor regulating leucinostatin production in the filamentous fungus Paecilomyces lilacinus was characterized by a gene knockout approach. The deduced proprotein consists of 705 amino acids and is highly homologous to the Zn(II)2Cys6 transcription factor of the entomopathogenic fungus Metarhizium brunneum. Predictive analysis of the secondary structure of the proportion showed that it has two domains. Paecilomyces lilacinus can produce nematotoxins leucinostatins A and B. Deletion of rolP from the P. lilacinus wild-type strain Pl36-1 leads to the absence of leucinostatin A, while a large increase in the leucinostatin A level was achieved in the rolP overexpression strain Ov-Pl36-1. During the process of nematode infection, rolP showed high expression levels at 48–72 h and peaked at 48 h. Bioassay tests confirmed the requirement of rolP for leucinostatin production. However, the root-knot second-stage juvenile-toxicity was minimized to 35.3% in ΔrolP; toxicity was 97.2% with Ov-Pl36-1 compared with 68.4% with the wild type strain Pl36-1. Interestingly, neither knockout nor overexpression of the rolP gene affected the growth or sporulation of P. lilacinus. Additionally, fungal nutrition and acidic media might stimulate the rolP activity of the wild type strain against nematodes. These findings suggested that the rolP gene is required for the induction and production of leucinostatins and is considered a leucinostatin regulatory gene in P. lilacinus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,772
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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