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Enregistrement W2260545953 · doi:10.1016/j.ajhg.2015.12.016

ZNF687 Mutations in Severe Paget Disease of Bone Associated with Giant Cell Tumor

2016· article· en· W2260545953 sur OpenAlexafffund
Giuseppina Divisato, Daniela Formicola, Teresa Esposito, Daniela Merlotti, Laura Pazzaglia, Andrea Del Fattore, Ethel S. Siris, Philippe Orcel, Jacques P. Brown, Ranuccio Nuti, Pasquale Strazzullo, Maria Serena Benassi, M. Leonor Cancela, Laëtitia Michou, Domenico Rendina, Luigi Gennari, Fernando Gianfrancesco

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoAmgen
Mots-clésPaget's disease of boneProtein Data Bank (RCSB PDB)OsteosarcomaMissense mutationBone remodelingPathologyNeoplastic transformationExome sequencingMutationBiologyCancer researchGeneMedicineGeneticsDiseaseCarcinogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Paget disease of bone (PDB) is a skeletal disorder characterized by focal abnormalities of bone remodeling, which result in enlarged and deformed bones in one or more regions of the skeleton. In some cases, the pagetic tissue undergoes neoplastic transformation, resulting in osteosarcoma and, less frequently, in giant cell tumor of bone (GCT). We performed whole-exome sequencing in a large family with 14 PDB-affected members, four of whom developed GCT at multiple pagetic skeletal sites, and we identified the c.2810C>G (p.Pro937Arg) missense mutation in the zinc finger protein 687 gene (ZNF687). The mutation precisely co-segregated with the clinical phenotype in all affected family members. The sequencing of seven unrelated individuals with GCT associated with PDB (GCT/PDB) identified the same mutation in all individuals, unravelling a founder effect. ZNF687 is highly expressed during osteoclastogenesis and osteoblastogenesis and is dramatically upregulated in the tumor tissue of individuals with GCT/PDB. Interestingly, our preliminary findings showed that ZNF687, indicated as a target gene of the NFkB transcription factor by ChIP-seq analysis, is also upregulated in the peripheral blood of PDB-affected individuals with (n = 5) or without (n = 6) mutations in SQSTM1, encouraging additional studies to investigate its potential role as a biomarker of PDB risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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