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Enregistrement W2260921139 · doi:10.1071/rdv28n2ab222

222 INCOMPLETE REPROGRAMMING OF INDUCED PLURIPOTENT STEM CELLS DERIVED FROM PORCINE FETAL FIBROBLASTS

2015· article· en· W2260921139 sur OpenAlexaff
Kwang‐Hwan Choi, Donghoon Son, D.-K. Lee, Jong‐Nam Oh, Seong‐Hyop Kim, T.-Y. Park, C.-K. Lee

Notice bibliographique

RevueReproduction Fertility and Development · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReprogrammingSOX2Homeobox protein NANOGInduced pluripotent stem cellBiologyKLF4Cell biologyEctopic expressionEpigeneticsXISTEmbryonic stem cellGeneticsCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular reprogramming of committed cells into a pluripotent state can be accomplished by ectopic expression of genes such as OCT4, SOX2, KLF4, and MYC. However, during reprogramming, it has been verified that failures of reactivating endogenous genes and epigenetic remodelling lead to partially reprogrammed cells exhibiting features similar to those of fully reprogrammed cells. In this study, partially reprogrammed induced pluripotent stem cells (pre-iPSC) were derived from porcine fetal fibroblasts via drug-inducible vector carrying human transcription factors (OCT4, SOX2, KLF4, and MYC). Therefore, this study aimed to investigate characteristics of pre-iPSC and reprogramming mechanisms. The pre-iPSC were stably maintained over an extended period having in vitro differentiation ability into 3 germ layers. The pluripotent state of pre-iPSC was regulated by modulation of culture condition. They showed naive- or primed-like pluripotent state in leukemia inhibitory factor (LIF) or basic fibroblast growth factor (bFGF) supplemented culture conditions respectively. However, pre-iPSC could not be maintained without ectopic expression of transgenes. The cultured pre-iPSC expressed endogenous transcription factors (OCT4 and SOX2) except for NANOG known as gateway into complete reprogramming. In addition, endogenous genes related to mesenchymal-to-epithelial transition (DPPA2, CDH1, EPCAM, and OCLN) were not sufficiently reactivated as measured by qPCR. DNA methylation analysis for promoters of OCT4, NANOG, and XIST showed that epigenetic reprogramming did not occurred in female pre-iPSC. Given the results, we found that expression of exogenous genes could not sufficiently activate the essential endogenous genes and remodel the epigenetic milieu for achieving faithful pluripotency in pig. Accordingly, investigating pre-iPSC could help us to improve and develop reprogramming methods via understanding reprogramming mechanisms in pig. This work was supported by the Next-generation BioGreen 21 Program (PJ0113002015), Rural Development Administration, Republic of Korea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,722

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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