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Enregistrement W2260924886 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.643.4

Effects of pregnancy status, individual animal and age of pigs on plasma metabolome (643.4)

2014· article· en· W2260924886 sur OpenAlexafffundabout
Soenke Moehn, Rupasri Mandal, Trent C. Bjorndahl, Faizath S. Yallou, David S. Wishart, Paul B. Pencharz, Ronald O. Ball, Graham Plastow

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Livestock and Meat Agency
Mots-clésMetabolomePalmitic acidMetabolomicsLinoleic acidPregnancyBiologyInternal medicineEndocrinologyFatty acidChemistryBiochemistryMedicineBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective was to assess the metabolome of reproducing pigs. The effect of age and individual pigs was studied in non‐pregnant vs. pregnant pigs, and in early (EG) vs. late pregnancy (LG). The effect of stage of pregnancy was studied in adolescent (parity 2) vs. adult pigs (parity 4). The metabolome of 331 plasma samples from 19 sows was analyzed by nuclear magnetic resonance, gas chromatography‐mass spectroscopy (MS) and direct injection MS. Data were evaluated using partial least square‐discriminant analysis in www.metaboanalyst.ca . Parity affected (P=0.001) the metabolome in EG and LG but not at maintenance. There were no common features for EG and LG within parity, i.e. no metabolites changed with age of pig in both EG and LG. In EG, phospholipids were important features, in LG amino acids, urea and fatty acids. The metabolome differed among individual pigs in EG and LG (P<0.001) but not at maintenance. Aspartate was the only common feature in maintenance and at both stages of pregnancy, and was greater (P=0.039) in LG than EG. Among pigs, the majority of important features in EG were (glycero‐) phospholipids and fatty acids in LG. The stage of pregnancy affected the metabolome in parity 2 and 4 (P<0.01) with palmitic and linoleic acid and galactose common important features. The increase of palmitic and linoleic acid in LG may indicate lipid mobilization due to the energy deficit of pigs in LG. The greatest impact on the metabolome was the stage of pregnancy, individual animals and the maturity of pigs. These physical characteristics need consideration when assessing the metabolome of reproducing pigs. Grant Funding Source : Alberta Livestock and Meat Agency

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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