Recording of climate and diagenesis through fossil pigments and sedimentary DNA at Laguna Potrok Aike, Argentina
Notice bibliographique
Résumé
Abstract. Aquatic sediments record past climatic conditions while providing a wide range of ecological niches for microorganisms. Although marine sedimentary microbial assemblages are often defined by their surrounding geochemical conditions, the influence of environmental features upon microbial development and post-depositional survival remains largely unknown in the lacustrine realm. Due to long-term microbial activity, the composition of environmental DNA can be expected to evolve with sediment depth and over time and therefore should reflect both ancient and extant microbial populations, but this hypothesis has rarely been tested using a multiproxy approach. Here geomicrobiological and phylogenetic analyses of a Patagonian maar lake were used to indicate that the different sedimentary microbial assemblages derive from specific lacustrine regimes during defined climatic periods. Two well defined climatic intervals whose sediments harboured active microbial populations and measurable ATP were sampled for a comparative environmental study based on fossil pigments and 16S rRNA gene sequences. Bacterial and archaeal 16S rRNA gene sequences recovered from the Holocene record revealed a microbial community adapted to subsaline conditions actively producing methane during organic matter degradation. These characteristics were associated with sediments resulting from endorheic lake conditions with high evaporative stress and concomitant high algal productivity. Moreover, archaeal clone libraries established throughout the Holocene record indicate an age-related stratification of these populations, consistent with a gradual use of organic substrates after deposition. In contrast, sulphate-reducing bacteria and lithotrophic Archaea were predominant in sediments dated from the Last Glacial Maximum, in which pelagic clays alternated with fine volcanic material characteristic of a lake level highstand and freshwater conditions, but reduced water column productivity. These patterns reveal that microbial assemblages identified from environmental DNA stemmed from a variety of sedimentary niches associated with climate-dependent factors (catchment inflows, water column conditions, productivity), but that initial assemblages underwent structural changes and selective preservation during early diagenesis to result in the final composition entombed in the sediments. We conclude that environmental DNA obtained from lacustrine sediments provides essential genetic information to complement paleoenvironmental indicators and trace climate change and post-depositional diagenetic processes over tens of millennia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».