Molecular characterization of the<i>bla</i><sub>KPC-2</sub>gene in clinical isolates of carbapenem-resistant<i>Klebsiella pneumoniae</i>from the pediatric wards of a Chinese hospital
Notice bibliographique
Résumé
The present study was conducted to confirm the presence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing K. pneumoniae associated with a nosocomial outbreak in a Chinese pediatric hospital. From July 2009 to January 2011, 124 nonduplicated K. pneumoniae isolates were collected from specimens from patients of pediatric units in the hospital. Twelve of the 124 isolates possessed the bla(KPC-2) gene and showed 7 different pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) patterns. Meanwhile, 16S rRNA methylase, acc(6')-Ib-cr, and several types of β-lactamases were also produced by the majority of the KPC-producing isolates. Class 1 integron-encoded intI1 integrase gene was subsequently found in all strains, and amplification, sequencing, and comparison of DNA between 5' conserved segment and 3' conserved segment region showed the presence of several known antibiotic resistance gene cassettes of various sizes. The conjugation and plasmid-curing experiments indicated some KPC-2-encoding genes were transmissible. In addition, conjugal cotransfer of multidrug-resistant phenotypes with KPC-positive phenotypes was observed in KPC-producing strains. Restriction endonuclease analysis and DNA hybridization with a KPC-specific probe showed that the bla(KPC-2) gene was carried by plasmid DNA from K. pneumoniae of PFGE pattern B. The overall results indicate that the emergence and outbreak of KPC-producing K. pneumoniae in our pediatric wards occurred in conjunction with plasmids coharboring 16S rRNA methylase and extended-spectrum β-lactamases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».