MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2261604215 · doi:10.1139/w2012-094

Molecular characterization of the<i>bla</i><sub>KPC-2</sub>gene in clinical isolates of carbapenem-resistant<i>Klebsiella pneumoniae</i>from the pediatric wards of a Chinese hospital

2012· article· en· W2261604215 sur OpenAlexvenueno aff
Yang Liu, Xiangyang Li, La‐Gen Wan, Wei-Yan Jiang, Fang-Qu Li, Jing-Hong Yang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeIntegronBiologyPulsed-field gel electrophoresisPlasmidMicrobiologyRestriction enzyme16S ribosomal RNAGeneVirologygenomic DNAGenotypeGeneticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study was conducted to confirm the presence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing K. pneumoniae associated with a nosocomial outbreak in a Chinese pediatric hospital. From July 2009 to January 2011, 124 nonduplicated K. pneumoniae isolates were collected from specimens from patients of pediatric units in the hospital. Twelve of the 124 isolates possessed the bla(KPC-2) gene and showed 7 different pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) patterns. Meanwhile, 16S rRNA methylase, acc(6')-Ib-cr, and several types of β-lactamases were also produced by the majority of the KPC-producing isolates. Class 1 integron-encoded intI1 integrase gene was subsequently found in all strains, and amplification, sequencing, and comparison of DNA between 5' conserved segment and 3' conserved segment region showed the presence of several known antibiotic resistance gene cassettes of various sizes. The conjugation and plasmid-curing experiments indicated some KPC-2-encoding genes were transmissible. In addition, conjugal cotransfer of multidrug-resistant phenotypes with KPC-positive phenotypes was observed in KPC-producing strains. Restriction endonuclease analysis and DNA hybridization with a KPC-specific probe showed that the bla(KPC-2) gene was carried by plasmid DNA from K. pneumoniae of PFGE pattern B. The overall results indicate that the emergence and outbreak of KPC-producing K. pneumoniae in our pediatric wards occurred in conjunction with plasmids coharboring 16S rRNA methylase and extended-spectrum β-lactamases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Microbiology→Même sujetAntibiotic Resistance in Bacteria→Travaux en français237 207→