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Enregistrement W2261925730 · doi:10.1200/jco.2007.25.18_suppl.10512

BRCA1/2 mutations and cancer risk in Asian-Americans

2007· article· en· W2261925730 sur OpenAlexaff
Allison W. Kurian, Nicolette M. Chun, Meredith Mills, Ashley D. Staton, Brittany Crawford, Yolanda Ridge, Susan S. Donlon, Gail Gong, Dee W. West, James M. Ford

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePenetranceMutationCancerEpidemiologyGeneticsInternal medicineOncologyBreast cancerDemographyGeneBiologyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

10512 Background: There are significant differences in breast cancer epidemiology between Caucasian and Asian-Americans and even between different Asian groups. These cancer risks and associated BRCA1/2 mutation prevalence have not been well defined in Asians; BRCA1/2 mutation penetrance might differ due to different risk modifiers. We report on a case-control study of BRCA1/2 mutation prevalence and cancer risk in Asian-American women. Methods: Clinical Data Collection: Chart review from cancer genetics services of 4 North American centers with highest Asian volume. BRCA1/2 Mutation Risk Assessment: BRCAPRO and Myriad II models, CancerGene version 4.3 (University of Texas). BRCA1/2 Mutation Testing: Full sequencing and large rearrangement panel (Myriad Genetics Inc.). Endpoints: BRCA1/2 mutation prevalence and predictive model accuracy (observed versus predicted mutations). Results: 43 of 181 Asians (23.8%) had a BRCA1/2 mutation; 36 (19.9%) had a variant of uncertain significance. The observed prevalence of BRCA1/2 mutations was 23.8% of women, which differs significantly from the predicted prevalence of 12.9% using BRCAPRO (p = 5.6 × 10-9), and the predicted prevalence of 12.6% using Myriad II. This 2-fold difference existed for Chinese, Japanese, and Filipina women (the ethnic sub-groups with enough cases available for comparisons), even though the percent with observed and predicted mutations varied for these three groups. Conclusions: One in 4 clinically tested Asian-Americans has a BRCA1/2 mutation. Standard models significantly under-predict mutations in Asians; consequently, Asians are likely under-tested for BRCA1/2 mutations. These results may reflect lower BRCA1/2-associated cancer risk in Asians compared to Caucasians. Comparison to Caucasian controls and to Asians in Hong Kong is underway, to investigate potential genetic and lifestyle modifiers of BRCA1/2-associated cancer risk. [Table: see text] No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,470
Écart entre enseignants0,410 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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