c-SRC protein tyrosine kinase regulates early HIV-1 infection post-entry
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: We investigated whether HIV-1 inhibition by SRC-family kinase inhibitors is through the non-receptor tyrosine kinase pp60 (c-SRC) and its binding partner, protein tyrosine kinase 2 beta (PTK2B). DESIGN: CD4 T-lymphocytes were infected with R5 (JR-FL) or X4 (HXB2) HIV-1. We used SRC-family kinase inhibitors or targeted siRNA knockdown of c-SRC and PTK2B, then monitored effects on the early HIV-1 lifecycle. METHODS: Four SRC-family kinase inhibitors or targeted siRNA knockdown were used to reduce c-SRC or PTK2B protein expression. Activated CD4 T-lymphocytes were infected with recombinant, nef-deficient, or replication-competent infectious viruses. Knockdown experiments examined early infection by monitoring: luciferase activity, expression of host surface receptors, reverse transcriptase activity, p24 levels and qPCR of reverse transcripts, integrated HIV-1, and two-long terminal repeat (2-LTR) circles. RESULTS: All SRC-family kinase inhibitors inhibited R5 and X4 HIV-1 infection. Neither c-SRC nor PTK2B siRNA knockdown had an effect on cell surface receptors (CD4, CXCR4, and CCR5) nor on reverse transcriptase activity. However, using JR-FL both decreased luciferase activity while increasing late reverse transcripts (16-fold) and 2-LTR circles (eight-fold) while also decreasing viral integration (four-fold). With HXB2, c-SRC but not PTK2B siRNA knockdown produced similar results. CONCLUSIONS: Our results suggest c-SRC tyrosine kinase is a major regulator of HIV-1 infection, participating in multiple stages of infection post-entry: Reduced proviral integration with increased 2-LTR circles is reminiscent of integrase inhibitors used in combination antiretroviral therapy. Decreasing c-SRC expression and/or activity provides a new target for antiviral intervention and the potential for repurposing existing FDA-approved kinase inhibitors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».