Genome-wide analysis of sperm DNA methylation from monozygotic twin bulls
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Monozygotic (MZ) twins are of great interest to elucidate the contributions of pre- and postnatal environmental factors on epigenetics in the expression of complex traits and diseases. Progeny testing recently revealed that MZ twin bulls do not necessarily lead to identical genetic merit estimates (i.e. breeding values). Therefore, to explain differences in offspring productivity of MZ twin bulls despite their identical genetic backgrounds, we hypothesised that paternal sperm epigenomes vary between MZ twin bulls. In the present study, semen characteristics and global sperm DNA methylome were profiled for four pairs of MZ twin bulls. Some MZ twin pairs had divergent semen quality (sperm morphology, motility and viability). Comparative genome-wide DNA methylome surveys were performed using methyl-sensitive enrichment and microarray identification. Between 2% and 10% of all probes (400000) were differentially methylated between MZ twin pairs. In addition, there were 580 loci differentially methylated across all pairs of MZ twins. Furthermore, enrichment analysis indicated a significant enrichment for fertility associated quantitative trait loci (P=0.033). In conclusion, differences in the sperm epigenome may contribute to incongruous diverging performances of daughters sired by bulls that are MZ twins.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle