Phylogenetic analysis and tissue distribution of elasmobranch glucose transporters and their response to feeding
Notice bibliographique
Résumé
Elasmobranch diets consist of high quantities of protein and lipids, but very low levels of carbohydrates including glucose. Reflecting this diet, most tissues use lipids and ketone bodies as their main metabolic fuel. However, the rectal gland has been shown to be dependent on glucose as a fuel, so we hypothesized that glucose transporters (GLUTs) would be present and upregulated in the gland during times of activation (e.g. following a meal). In this study, we searched for and identified putative class I GLUTs in three elasmobranchs and a holocephalan using transcriptomes, and used these to reconstruct a Bayesian phylogeny. We determined that each of the four species possessed three of the four class I GLUT sequences, but the identities of the isoforms present in each species differed between the elasmobranchs (GLUT1, 3 and 4) and the holocephalan (GLUT1, 2 and 3). We then used qPCR to measure mRNA levels of these GLUTs in the rectal gland, liver, intestine, and muscle of fed and starved spiny dogfish (Squalus suckleyi). The rectal gland data showed higher mRNA levels of GLUT4 in the starved relative to the fed fish. In the muscle, both GLUT1 and 4 were significantly elevated at 24 h post-feeding, as was the case for GLUT4 in the liver. In the intestine on the other hand, GLUT4 was significantly elevated by 6 h post-feeding, remaining elevated through 48 h. We suggest that GLUT4 has taken on the role of GLUT2 in elasmobranchs as the expression patterns observed in the liver and intestine are representative of GLUT2 in other vertebrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».