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Enregistrement W2264509482 · doi:10.1161/atvb.34.suppl_1.478

Abstract 478: Single-Cell Isolation and Analysis of Viable Proliferating Macrophages From Atherosclerotic Plaques

2014· article· en· W2264509482 sur OpenAlexaff
Caleb C. J. Zavitz, Sherine Ensan, Clinton S. Robbins

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAtherosclerosis and Cardiovascular Diseases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCollagenaseCell sortingBiologyMacrophageStainingCellPathologyMolecular biologyCell biologyFlow cytometryIn vitroBiochemistryMedicineEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: We have recently shown that the proliferation of macrophages within the atherosclerotic plaque, rather than the recruitment of new monocytes from the blood is the key driver of plaque growth in established atherosclerosis. The study of proliferating macrophages has been hampered by the lack of a technique for identifying proliferating macrophages and isolating them from the atherosclerotic plaque in a viable state. OBJECTIVE: Develop and validate a process for identifying proliferating macrophages in atherosclerotic lesions, and isolating them as single, viable cells, then perform a molecular characterization of these cells. METHODS: ApoE-/- and LDLR-/- mice were fed a diet high in fat and cholesterol. Atherosclerotic aortas were collected, and cells were isolated by mechanical and enzymatic dissociation. Cells were stained using fluorescent markers and DNA-binding dyes, then analyzed and isolated by fluorescence-activated cell sorting. RESULTS: Mincing and enzymatic digestion in collagenase I, collagenase XI, DNAse, and hyaluronidase optimally isolates macrophages from aortic explants. Cell-surface staining with fluorescent antibodies against B220, F4/80, Ly6c, MHC II, and CD11b allows identification of lesional macrophages. DNA staining with Vybrant DyeCycle Violet allows identification of proliferating cells. Combined, these processes allow for the FACS-based sorting of viable proliferating macrophages from atherosclerotic plaque, and subsequent RNA or protein analysis, or culture. CONCLUSIONS: The process described here allows the first-ever viable isolation of proliferating macrophages from atherosclerotic plaques. This will permit the investigation of molecular targets to interfere with the pathogenesis of atherosclerosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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