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Enregistrement W2265097017 · doi:10.1093/gbe/evv263

Evidence of Natural Hybridization in Brazilian Wild Lineages of<i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2016· article· en· W2265097017 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenome Biology and Evolution · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFermentation and Sensory Analysis
Établissements canadiensUniversité de MontréalCégep Marie-VictorinUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisUniversidade Federal de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésBiologyPopulationPopulation genomicsDomesticationPhylogeographyNatural population growthEcologyEvolutionary biologyPhylogeneticsGeneticsGenomeGenomicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The natural biology of Saccharomyces cerevisiae, the best known unicellular model eukaryote, remains poorly documented and understood although recent progress has started to change this situation. Studies carried out recently in the Northern Hemisphere revealed the existence of wild populations associated with oak trees in North America, Asia, and in the Mediterranean region. However, in spite of these advances, the global distribution of natural populations of S. cerevisiae, especially in regions were oaks and other members of the Fagaceae are absent, is not well understood. Here we investigate the occurrence of S. cerevisiae in Brazil, a tropical region where oaks and other Fagaceae are absent. We report a candidate natural habitat of S. cerevisiae in South America and, using whole-genome data, we uncover new lineages that appear to have as closest relatives the wild populations found in North America and Japan. A population structure analysis revealed the penetration of the wine genotype into the wild Brazilian population, a first observation of the impact of domesticated microbe lineages on the genetic structure of wild populations. Unexpectedly, the Brazilian population shows conspicuous evidence of hybridization with an American population of Saccharomyces paradoxus. Introgressions from S. paradoxus were significantly enriched in genes encoding secondary active transmembrane transporters. We hypothesize that hybridization in tropical wild lineages may have facilitated the habitat transition accompanying the colonization of the tropical ecosystem.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,782
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle