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Enregistrement W2265184877 · doi:10.1186/s12929-016-0230-y

Chromosomal disruption and rearrangements during murine sarcoma development converge to stable karyotypic formation kept by telomerase overexpression

2016· article· en· W2265184877 sur OpenAlexfundno aff
Robson José de Oliveira-Júnior, Carlos Ueira‐Vieira, Angela Aparecida Servino Sena, Carolina Fernandes Reis, José Roberto Mineo, Luíz Ricardo Goulart, Sandra Morelli

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomedical Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoUniversidade Federal de UberlândiaInstitute of GeneticsCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésTelomeraseTelomereBiologyKaryotypeSarcomaCancer researchTelomerase reverse transcriptaseGeneticsDNACell biologyGeneChromosomePathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Tumor initiation presents a complex and unstable genomic landscape; one of the earliest hallmark events of cancer, and its progression is probably based on selection mechanisms under specific environments that lead to functional tumor cell speciation. We hypothesized that viable tumor phenotypes possess common and highly stable karyotypes and their proliferation is facilitated by an attuned high telomerase activity. Very few investigations have focused on the evolution of common chromosomal rearrangements associated to molecular events that result in functional phenotypes during tumor development. RESULTS: We have used cytogenetic, flow cytometry and cell culture tools to investigate chromosomal rearrangements and clonality during cancer development using the murine sarcoma TG180 model, and also molecular biology techniques to establish a correlation between chromosome instability and telomerase activity, since telomeres are highly affected during cancer evolution. Cytogenetic analysis showed a near-tetraploid karyotype originated by endoreduplication. Chromosomal rearrangements were random events in response to in vitro conditions, but a stable karyotypic equilibrium was achieved during tumor progression in different in vivo conditions, suggesting that a specific microenvironment may stabilize the chromosomal number and architecture. Specific chromosome aberrations (marker chromosomes) and activated regions (rDNAs) were ubiquitous in the karyotype, suggesting that the conservation of these patterns may be advantageous for tumor progression. High telomerase expression was also correlated with the chromosomal rearrangements stabilization. CONCLUSIONS: Our data reinforce the notion that the sarcoma cell evolution converges from a highly unstable karyotype to relatively stable and functional chromosome rearrangements, which are further enabled by telomerase overexpression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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