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Enregistrement W2265259074 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.936.6

Human Plasma Membrane Anion Exchanger, AE1: Over‐expression in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2008· article· en· W2265259074 sur OpenAlexafffundabout
Pamela Therese Bonar, Joseph R. Casey

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeChemistryBiochemistryMembraneRhodopsinHeterologous expressionChromatographyUltracentrifugeYeastRecombinant DNAMolecular biologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anion exchanger 1 (AE1) facilitates the exchange of chloride for bicarbonate across the plasma membrane of renal and erythrocyte membranes. The 55 kDa membranedomain of AE1 alone is responsible for its transport function, however a high resolution structure of this domain has not been solved. The limiting factor to obtaining acrystal structure is the availability of homogenous, purified AE1. Here we developed a novel expression and efficient purification system for AE1, using S. cerevisiae to allow for large‐scale expression, while maintaining proper folding of AE1. The expression construct consists of the AE1 membrane domain (AE1MD), residues 388–911 of human AE1, followed by the 9 C‐terminal amino acids of rhodopsin. Expression was under the control of the constitutive promoter and transcriptionalterminator of the yeast H + ‐ATPase gene. AE1MD was expressed in S. cerevisiae, strain BJ5457, to 0.3 mg AE1MD per litre of culture. We characterized the cellularlocalization of AE1MD by confocal immunofluorescence microscopy and sucrose gradient ultracentrifugation. AE1MD structure was assessed by binding to animmobilized anion exchange inhibitor (SITS‐Affi‐gel). Once solubilized by the detergent n‐dodecyl‐β‐D‐maltoside, AE1MD was purified with a 1D4 antibody affinitycolumn, which recognizes the rhodopsin tag on AE1MD. This research is supported by the Canadian Institutes of Health Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,367

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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