Expression and characterization of the anion transporter homologue YNL275w in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
A search of the yeast Saccharomyces cerevisiae genome has revealed an open reading frame, YNL275w, which encodes a 576-amino acid protein that shows sequence similarity to the family of mammalian Cl-/HCO3- anion exchangers and Na+/HCO3- cotransporters. This yeast protein also has a very similar hydropathy profile to the mammalian HCO3- transporters, indicating a similar membrane topology and structure. A V5 epitope and His6-tagged version of Ynl275wp was expressed in yeast and was localized to the plasma membrane by subcellular fractionation and immunofluorescence labeling. The protein was purified by nickel affinity chromatography and was found not to be N-glycosylated. The protein's mobility on SDS-PAGE gels was not altered by treatment with N-glycanase F, alpha-mannosidase, or by mutation of each of the five consensus N-glycosylation sites. The protein did not bind to concanavalin A by lectin blotting or lectin affinity chromatography. The expressed protein bound specifically to a stilbene disulfonate inhibitor resin (SITS-Affi-Gel), and this binding could be competed by certain anions (HCO3-, Cl-, NO3-, and I-) but not by others (SO4(2-) and PO4(3-)). These results suggest that the yeast gene YNL275w encodes a nonglycosylated anion transport protein, localized to the plasma membrane.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».