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Enregistrement W2266095070

Abstract 16942: Effects of BMPR2 Mutations on Global MicroRNA Expression Profiles in Blood Outgrowth Endothelial Cells from Patients with Pulmonary Arterial Hypertension

2012· article· en· W2266095070 sur OpenAlexaff
Kenny Schlosser, Mark L. Ormiston, Nicholas W. Morrell, Duncan J. Stewart

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePulmonary Hypertension Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBMPR2MedicineMutationGene silencingmicroRNACancer researchGeneImmunologyPathologyBiologyGeneticsBone morphogenetic protein
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Mutations of the bone morphogenetic protein receptor 2 gene ( BMPR2 ) are found in patients with heritable (H) or idiopathic (I) pulmonary arterial hypertension (PAH). However, their role in abnormalities of endothelial cell (EC) growth and survival in PAH is unclear. Therefore, blood-outgrowth endothelial cells (BOECs), which closely resemble mature endothelial cells, were used to study patient-specific effects of BMPR2 mutations on endothelial microRNAs (miRNA), which are recognized to be key regulators of gene expression. Hypothesis: Disease-specific alterations in miRNA expression profiles in BOECs from patients with HPAH or IPAH, with and without BMPR2 mutations, contribute to the previously reported abnormalities in EC growth and survival in this disease. Methods: BOECs were derived from the peripheral blood mononuclear cell fraction isolated from 7 patients (4 HPAH with BMPR2 mutations, and 3 IPAH) and 5 healthy controls (including 1 unaffected BMPR2 mutation carrier). Cells were characterized by cobblestone morphology and surface marker profile (cd31+/cd45-/cd14-/cd34+/KDR+). 1066 miRNAs were measured using an (RT)-qPCR array platform (Qiagen), and normalized with a mean-centering restricted method. Results: 767 ± 30 miRNAs were detected in BOECs from the 12 participants (PCR Cq cutoff BMPR2 mutations vs. controls (p BMPR2 mutation carrier. Conclusion: A global analysis of miRNAs in BOECs revealed distinct profiles in IPAH and HPAH patients, with both disease- and BMPR2 mutation-specific patterns of expression. These data suggest that unique miRNAs may contribute to alterations in endothelial gene expression that underlie abnormalities in EC growth and survival, and may be novel targets for therapeutic and biomarker development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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