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Enregistrement W2266150212 · doi:10.1038/ncomms9623

Phosphoinositide 3-kinase enables phagocytosis of large particles by terminating actin assembly through Rac/Cdc42 GTPase-activating proteins

2015· article· en· W2266150212 sur OpenAlexafffund
Daniel Schlam, Richard D. Bagshaw, Spencer A. Freeman, Richard F. Collins, Tony Pawson, Gregory D. Fairn, Sergio Grinstein

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of TorontoUniversity of New BrunswickLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalCanada Research ChairsHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenCystic Fibrosis CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPhagocytosisCell biologyInternalizationCDC42PhagosomeSmall GTPasePhosphatidylinositolBiologyRAC1PI3K/AKT/mTOR pathwayGTPaseKinaseChemistrySignal transductionCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phagocytosis is responsible for the elimination of particles of widely disparate sizes, from large fungi or effete cells to small bacteria. Though superficially similar, the molecular mechanisms involved differ: engulfment of large targets requires phosphoinositide 3-kinase (PI3K), while that of small ones does not. Here, we report that inactivation of Rac and Cdc42 at phagocytic cups is essential to complete internalization of large particles. Through a screen of 62 RhoGAP-family members, we demonstrate that ARHGAP12, ARHGAP25 and SH3BP1 are responsible for GTPase inactivation. Silencing these RhoGAPs impairs phagocytosis of large targets. The GAPs are recruited to large--but not small--phagocytic cups by products of PI3K, where they synergistically inactivate Rac and Cdc42. Remarkably, the prominent accumulation of phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate characteristic of large-phagosome formation is less evident during phagocytosis of small targets, accounting for the contrasting RhoGAP distribution and the differential requirement for PI3K during phagocytosis of dissimilarly sized particles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations212
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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