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Enregistrement W2266236244 · doi:10.1128/jcm.01632-15

Molecular Assay for Detection of Ciprofloxacin Resistance in Neisseria gonorrhoeae Isolates from Cultures and Clinical Nucleic Acid Amplification Test Specimens

2015· article· en· W2266236244 sur OpenAlexaff
Shelley Peterson, Irene Martín, Walter Demczuk, Amrita Bharat, Linda Hoang, John Wylie, Vanessa Allen, Brigitte Lefebvre, Greg Tyrrell, Greg B. Horsman, David Haldane, Richard Garceau, Tom Wong, M. R. Mulvey

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensQueen Elizabeth II Health Sciences CentreUniversity of ManitobaSaskatchewan Disease Control LaboratoryDr. Georges-L.-Dumont University Hospital CentreProvincial Laboratory of Public HealthPublic Health Agency of CanadaToronto Public HealthSte. Anne's HospitalPublic Health OntarioBC Centre for Disease Control
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeMicrobiologyNeisseriaceaeBiologyCiprofloxacinNucleic acidNucleic Acid Amplification TestsVirologyGeneticsAntibioticsChlamydia trachomatis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We developed a real-time PCR assay to detect single nucleotide polymorphisms associated with ciprofloxacin resistance in specimens submitted for nucleic acid amplification testing (NAAT). All three single nucleotide polymorphism (SNP) targets produced high sensitivity and specificity values. The presence of ≥2 SNPs was sufficient to predict ciprofloxacin resistance in an organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,413
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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