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Enregistrement W2266356262 · doi:10.1093/nar/gkw027

Foxo3 circular RNA retards cell cycle progression via forming ternary complexes with p21 and CDK2

2016· article· en· W2266356262 sur OpenAlexafffund
William W. Du, Weining Yang, Elizabeth Liu, Zhenguo Yang, Preet Dhaliwal, Burton B. Yang

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyCircular RNACyclin-dependent kinase 2Cell cycleCyclin ACyclin-dependent kinaseCell biologyCyclin E1Small nucleolar RNACyclin ERestriction pointCyclin DCyclin A2Non-coding RNAmicroRNACellGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most RNAs generated by the human genome have no protein-coding ability and are termed non-coding RNAs. Among these include circular RNAs, which include exonic circular RNAs (circRNA), mainly found in the cytoplasm, and intronic RNAs (ciRNA), predominantly detected in the nucleus. The biological functions of circular RNAs remain largely unknown, although ciRNAs have been reported to promote gene transcription, while circRNAs may function as microRNA sponges. We demonstrate that the circular RNA circ-Foxo3 was highly expressed in non-cancer cells and were associated with cell cycle progression. Silencing endogenous circ-Foxo3 promoted cell proliferation. Ectopic expression of circ-Foxo3 repressed cell cycle progression by binding to the cell cycle proteins cyclin-dependent kinase 2 (also known as cell division protein kinase 2 or CDK2) and cyclin-dependent kinase inhibitor 1 (or p21), resulting in the formation of a ternary complex. Normally, CDK2 interacts with cyclin A and cyclin E to facilitate cell cycle entry, while p21works to inhibit these interactions and arrest cell cycle progression. The formation of this circ-Foxo3-p21-CDK2 ternary complex arrested the function of CDK2 and blocked cell cycle progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 859
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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