MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2267210085 · doi:10.4049/jimmunol.190.supp.138.18

Differences in both Toll-like receptor 4 and MD-2 account for the host-specific recognition of <i>Bordetella pertussis</i> lipid A (P1240)

2013· article· en· W2267210085 sur OpenAlexaff
Nina Maeshima, Adeline M. Hajjar, Rachel C. Fernandez

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTLR4Lipid ABordetella pertussisToll-like receptorLipopolysaccharideBiologyInnate immune systemReceptorPattern recognition receptorMutagenesisMicrobiologyBiochemistryGeneBacteriaMutationImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The lipid A portion of lipopolysaccharide (LPS) activates innate immunity through the Toll-like receptor 4 (TLR4)/MD-2 complex on host cells. Variation in lipid A has significant consequences for TLR4 activation and thus may be a means by which pathogenic bacteria modulate host immunity. We have previously seen that strain BP338 of Bordetella pertussis modifies its lipid A by the addition of glucosamine moieties which promote TLR4 activation in human macrophages. In the absence of glucosamine modification, TLR4 activation is attenuated. This effect is host-specific: glucosamine modification does not affect mouse TLR4 activation. We hypothesized that the species-specific effect is due to differences in TLR4, and used inter-species chimeric receptors to test this hypothesis. We found that the middle 330 amino acids of TLR4 were sufficient to generate species-specific responses to B. pertussis lipid A, dependent on co-expression of the matching species of MD-2. Based on the published crystal structure of TLR4/MD-2 in complex with E. coli LPS, we narrowed our search to the interface where TLR4/MD-2 complexes dimerize for activation, and used site-directed mutagenesis to identify specific amino acid residues in TLR4 and MD-2 that promote activation in response to B. pertussis lipid A. Taken together, we have demonstrated that charged amino acids in TLR4 and MD-2 contribute to host-specific immune responses to lipid A variants from B. pertussis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Immunology→Même sujetBacterial Infections and Vaccines→Travaux en français237 207→