Abstract TMP50: A Polymorphism in <i>HDAC9</i> was Associated with Large Vessel Stroke in the Vienna and German Stroke Studies
Notice bibliographique
Résumé
Introduction The International Stroke Genetics Consortium (ISGC) and the Wellcome Trust Case Control Consortium 2 (WTCCC2) performed a large genome wide association study of ischemic stroke and its subtypes (large vessel stroke (LVD), small vessel stroke (SVD), cardioembolic stroke (CE)), and identified a polymorphism in HDAC9 (rs11984041) associated with the LVD subtype of ischemic stroke. Hypothesis We assessed the hypothesis that rs11984041 is associated with LVD in two additional studies. Methods The genotype of rs11984041 was determined for participants of the Vienna Study (815 controls, 122 LVD, 165 SVD, 202 CE) and of the German Study (1040 controls, 495 LVD, 230 SVD, 462 CE). The association of rs11984041 with LVD was assessed by logistic regression. Heterogeneity of the effect of rs11984041 on LVD, CE or SVD was assessed by testing the equality of the corresponding regression coefficients from a multinomial logistic regression model. Results Carriers of the minor (T) allele of rs11984041 (23.3% of LVD cases and 17.4% of controls), compared with noncarriers, had increased risk for LVD: the odds ratios (OR) were 1.92 (95%CI 1.25-2.96) for the Vienna Study and 1.33 (95%CI 1.02-1.74) for the German Study. Adjusting for covariates including sex, age, diabetes, and hypertension did not materially change the ORs. Heterogeneity of the effects of rs11984041 on LVD vs CE was significant in the Vienna Study (p = 0.009) and in the German Study (p = 0.005). Heterogeneity of the effects of rs11984041 on LVD vs SVD trended toward significance in the Vienna Study (p = 0.088) and was significant in the German Study (p = 0.047). Adjusting for covariates did not materially change the heterogeneity test p values. Conclusions The HDAC9 polymorphism rs11984041 was associated with the LVD stroke subtype in the Vienna Study and the German Study. These results replicated the ISGC/WTCCC2 findings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».