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Enregistrement W2268470141 · doi:10.4161/nucl.11739

SMARCAL1 and replication stress

2010· article· en· W2268470141 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNucleus · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyDNA damageDNA replicationGenome instabilityChromatinCell biologyDNAContext (archaeology)DNA repairTranscription (linguistics)GeneticsPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SNF2 family of ATPases acts in the context of chromatin to regulate transcription, replication, repair, and recombination. Defects in SNF2 genes cause many human diseases. For example, mutations in SMARCAL1 (also named HARP) cause Schimke immuno-osseous dysplasia (SIOD); a multi-system disorder characterized by growth defects, immune deficiencies, renal failure and other complex phenotypes. Several groups including ours recently identified SMARCAL1 as a replication stress response protein. Importantly, SMARCAL1 localizes to stalled replication forks and this localization of SMARCAL1 activity prevents DNA damage accumulation during DNA replication. We determined that SIOD-related SMARCAL1 mutants could not prevent replication-associated DNA damage in cells in which endogenous SMARCAL1 was silenced, establishing the first link between SIOD and a defect in a specific biological activity. Here, we also report that cells from patients with SIOD exhibit elevated levels of DNA damage that can be rescued by re-introduction of wild-type SMARCAL1. Our data suggest that loss of SMARCAL1 function in patients may cause DNA replication-associated genome instability that contributes to the pleiotropic phenotypes of SIOD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,586
Score d'incertitude au seuil0,209

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle