Determination of the orientation of NleA at the Golgi membrane by antibody accessibility
Notice bibliographique
Résumé
Les Escherichia coli entéropathogéniques (EPEC) et les Escherichia coli entérohémorrhagiques (EHEC) utilisent un système de sécrétion de type III afin d'injecter des protéines effectrices directement dans le cytoplasme des cellules hôtes infectées. NleA (non-LEE encoded effector A) est une protéine effectrice essentielle à la virulence qui, une fois injectée dans la cellule hôte, est localisée à l'appareil de Golgi. NleA s'associe fortement aux membranes des cellules infectées de façon similaire aux protéines intégrales de membrane; la bioinformatique prédit qu'il existe deux domaines transmembranaires putatifs chez NleA. Dans cette étude, nous avons utilisé la microscopie à fluorescence ainsi que des techniques de perméabilisation sélective et spécifique pour la membrane plasmique des cellules hôtes infectées par les EPEC afin de déterminer l'accessibilité des différents domaines de NleA à des antisérums spécifiques. Tous les domaines de NleA examinés ont été localisés du côté cytoplasmique, suggérant que NleA interagit avec l'appareil de Golgi de manière similaire à une protéine de membrane périphérique. Ces résultats démontrent la nécessité d'étudier plus en détails l'association de NleA avec la membrane de l'appareil de Golgi de la cellule hôte.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».