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Enregistrement W2269441102 · doi:10.1161/atvb.34.suppl_1.1

Abstract 1: Role of MicroRNAs in Postranscriptional Regulation of Apolipoprotein B-100 mRNA

2014· article· en· W2269441102 sur OpenAlexaff
Sahar Ansari Basir, Tiffany Asante, Khosrow Adeli

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApolipoprotein BmicroRNAMessenger RNAPsychological repressionTranslational efficiencyMolecular biologyTransfectionUntranslated regionThree prime untranslated regionBiologyGene expressionRegulation of gene expressionCell biologyTranslation (biology)GeneGeneticsBiochemistryCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatic apolipoprotein B-100 (apoB) synthesis and secretion appears to be regulated largely at the posttranscriptional and posttranslational levels. MicroRNAs (miRNAs) are among posttranscriptional regulators of gene expression that bind to complementary sequences on target messenger RNA (mRNA) transcripts, usually resulting in translational repression or degradation. It is unknown whether specific miRNAs are involved in posttranscriptional regulation of apoB mRNA. We performed bioinformatic analysis, showing that two specific miRNAs with satisfactory E-values level (with levels indicating greater similarity between the input and its match) namely, miR-544 (E-value = 0.91) and miR-1202 (E-value=0.86) have potential to interact with 3’ and 5’ UTR of apoB, respectively. We hypothesized that the interaction of these specific miRNAs (miR-544 and miR-1202) with the 3’ and 5’UTR of apoB mRNA leads to apoB mRNA translational repression and/or activation. Using a human hepatoma cell line model, HepG2, the effects of overexpressed miRNAs and inhibition of endogenous miRNAs on the expression of apoB mRNA and apoB protein synthesis were investigated. We further examined the effect of these miRNAs on apoB mRNA traffic into cytoplasmic P-bodies. Transfection of HepG2 cells with miR-544 led to a significant reduction in apoB mRNA expression and protein synthesis and induced an increase in the co-localization of apoB mRNA into P-bodies. The opposite effect was observed when anti-miR-544 was employed to inhibit the endogenous miR-544. Results from luciferase reporter assays indicated that the effects of miR-544 may be mediated via interaction with the 3’UTR of apoB mRNA. In contrast to miR-544, miR-1202 overexpression induced an increase in apoB mRNA expression and protein synthesis. Similarly, the opposite effect was observed when using anti-miR-1202. Data from luciferase reporter assays showed an increased expression of the reporter gene in constructs carrying 5’UTR of apoB mRNA suggesting that miR-1202 may function via the 5’UTR. In summary, these data demonstrate that specific miRNAs are involved in the regulation of expression and translational control of apoB mRNA in hepatocytes. However, these miRNAs do not appear to mediate insulin regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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