Fish cell DNA repair and breakage assays for assessing aquatic genotoxicity
Notice bibliographique
Résumé
It is claimed that many cancers in man are causally related to chemical carcinogen exposure. Similarly epidemiological studies of fish populations have associated an elevated tumor incidence with environments contaminated with chemicals, some of which have demonstrated carcinogenic activity. Sampling and pathologically screening large numbers of fish is labour intensive, costly, time-consuming, and field studies provide only circumstantial evidence for an etiological agent. A variety of quick and inexpensive assays have been used with mammalian cells to detect probable carcinogenic activity by analyzing for DNA-damaging events. More recently fish cells and metabolizing enzymes are being used in these assays in order to provide tests with more relevance to the aquatic environment, validate mammalian test results, determine fish cell sensitivity to genotoxic agents, and, ultimately, to develop techniques to directly assess the genotoxic:carcinogenic potential of a particular environment. The present study initially compared the DNA repair response in fish and mammalian cells. Although the measured repair response of fish cells was found to be very low, in comparison to mammalian cells, the assay procedure was altered to increase the fish cell sensitivity. Despite being able to detect DNA repair in fish cells treated with 3,4-benzopyrene the repair technique was felt to lack the sensitivity necessary for in vivo monitoring. However, the low amount of repair measurable in fish cells suggested that tests for DNA breakage may be more sensitive. Subsequent comparative experimentation with the chromosome aberration and micronucleus tests confirmed this. Treatment of fish cells with 3,4-benzopyrene resulted in chromosome aberrations. Polycyclic aromatic hydrocarbons like 3,4-benzopyrene are important aquatic contaminants and have been found in elevated concentrations in sediments from Sturgeon Bank, an area near Vancouver at which a sewage treatment plant discharges. Field testing the developed genotoxicity techniques indicated cytotoxicity and chromosome aberrations, but no DNA repair, in cultured fish and mammalian cells exposed to Sturgeon Bank sediment extracts. However, in a parallel test, an in vivo increase in micronuclei frequency in starry flounder could not be demonstrated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».