Validation of a genomic classifier for prediction of metastasis following postoperative salvage radiation therapy.
Notice bibliographique
Résumé
4 Background: Management of patients with a postoperative rising prostate-specific antigen (PSA) level is complex. Additional local treatment such as salvage radiation therapy (SRT) may be sufficient for many patients but some may require concurrent systemic therapy in order to delay or prevent metastatic disease. As PSA recurrence on its own is a poor surrogate for metastatic disease we hypothesized that the Decipher genomic classifier (GC), a validated predictor of metastasis may be able to better distinguish those patients where additional therapy is beneficial from those where SRT on its own is likely sufficient. Methods: Genomic classifier (GC) scores were calculated from 170 prostate cancer patients, who received SRT at the Veteran Affairs Medical Center Durham, Thomas Jefferson University and Mayo Clinic, between 1990 and 2010. SRT was defined as administration of RT with Pre-RT PSA levels > 0.2 ng/ml. GC and CAPRA-S scores were compared using survival c-index, competing-risks and Cox regression analysis for the prediction of metastasis. Results: Survival c-index for predicting metastasis 5 years post SRT was 0.85 (95% CI: 0.73-0.88) for GC and 0.63 (95% CI: 0.49-0.77) for CAPRA-S. The cumulative incidence of metastasis at 5 years post-SRT was 2.7%, 8.4%, and 33.1% for low, average, and high GC scores (p < 0.001) and 16.9%, 2.3% and 17.2% for low, average and high CAPRA-S scores (p = 0.113). In univariable analysis only GC, extraprostatic extension, path GS and Pre-RT PSA were significant predictors of metastasis. In multivariable analyses with clinical risk factors or the CAPRA-S risk model, GC was the only independent predictor of metastasis with a HR of 1.63 (1.22-2.18, p < 0.001) for a 10% unit increase in risk score. Conclusions: In patients treated with postoperative SRT for PSA recurrence, GC is a powerful predictor of metastasis. Patients with low Decipher have excellent prognosis with SRT and may avoid concurrent hormonal therapy. Patients with high Decipher risk are at highest risk for metastatic disease and SRT failure and may benefit from intensified systemic therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».