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Enregistrement W2270501918 · doi:10.2142/biophysico.13.0_1

Switching of the positive feedback for RAS activation by a concerted function of SOS membrane association domains

2016· article· en· W2270501918 sur OpenAlexfundno aff
Yuki Nakamura, Kayo Hibino, Toshio Yanagida, Yasushi Sako

Notice bibliographique

RevueBiophysics and Physicobiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRIKENSchool of Medicine, New York UniversityYork University
Mots-clésGuanine nucleotide exchange factorPositive feedbackCell biologyGTPaseMutantBiologyGTP'BiophysicsCell membraneCellNegative feedbackChemistryBiochemistryPhysicsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

studies have suggested that an interaction between SOS and the GTP-bound active form of RAS generates a positive feedback loop that propagates RAS activation. However, it remains unclear how the multiple domains of SOS contribute to the regulation of the feedback loop in living cells. Here, we observed single molecules of SOS in living cells to analyze the kinetics and dynamics of SOS behavior. The results indicate that the histone fold and Grb2-binding domains of SOS concertedly produce an intermediate state of SOS on the cell surface. The fraction of the intermediated state was reduced in positive feedback mutants, suggesting that the feedback loop functions during the intermediate state. Translocation of RAF, recognizing the active form of RAS, to the cell surface was almost abolished in the positive feedback mutants. Thus, the concerted functions of multiple membrane-associating domains of SOS governed the positive feedback loop, which is crucial for cell fate decision regulated by RAS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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