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Enregistrement W2270576132 · doi:10.1385/1-59259-029-2:67

Detection of Listeria monocytogenes by the Nucleic Acid Sequence-Based Amplification Technique

2003· book-chapter· en· W2270576132 sur OpenAlexaff
Burton W. Blais, G. S. Turner

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleic acidHot start PCRMultiple displacement amplificationBiologyOligonucleotidePrimer dimerPolymerase chain reactionMolecular biologyPolymeraseListeria monocytogenesPrimer (cosmetics)ListeriaTaq polymeraseDNAApplications of PCRBacteriaBiochemistryChemistryMultiplex polymerase chain reactionGeneticsDNA extractionThermus aquaticusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rapid detection of foodborne pathogens such as Listeria monocytogenes requires ultrasensitive techniques that give measurable responses with low numbers of the target bacteria in food samples or enrichment cultures. Although a number of approaches are possible for detection of low levels of target bacteria, including enzyme immunoassay (EIA) and nucleic acid probe hybridization, perhaps the most efficient approach from the viewpoint of detectability and specificity are the nucleic acid amplification techniques. Nucleic acid amplification targets specific nucleotide sequences within the bacterial genome and raises the number of copies of the region of interest to levels that are detectable by conventional means (e.g., agarose gel electrophoresis, DNA probes). A well-known example is the polymerase chain reaction (PCR) technique, which amplifies target DNA sequences by a mechanism involving hybridization of two oligonucleotide primers to opposite strands flanking the target region, followed by a repetitive series of cycles involving template denaturation, primer annealing, and the extension of primers by a DNA polymerase, typically the thermostable Taq polymerase, which enables the use of an automated thermal cycling device in this process. The amplification in a typical PCR process can result in a million-fold increase in the number of target sequence copies after 20 cycles ( 1 ). These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,018

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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