MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2270912873

Low BRCA1 and ERCC1 mRNA expression correlates with improved survival in ovarian cancer patients

2007· article· en· W2270912873 sur OpenAlexaboutno aff
Johanne I. Weberpals, Katherine V. Clark-Knowles, L. Haidari, Olga Antoniouk, Jim Dimitroulakos

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésERCC1Ovarian cancerOncologyChemotherapyInternal medicineStage (stratigraphy)MedicineBiologyCisplatinCancerSurvival analysisCancer researchNucleotide excision repairDNA repairGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A199 The poor prognosis of advanced-stage ovarian cancer is marked by early recurrences and resistance to platinum-based chemotherapy. Elevated levels of the DNA repair proteins, Breast Cancer 1 (BRCA1) and excision repair cross complementation group 1 (ERCC1) have been associated with increased resistance to cisplatinum in various malignancies including ovarian cancer. Purpose: The aim of this study was to analyze BRCA1 and ERCC1 mRNA expression as markers of recurrence and prognosis in ovarian cancer. Experimental procedures: Clinicopathologic data was collected on 22 patients who underwent surgical staging and adjuvant chemotherapy at The Ottawa Hospital between 2000 and 2005. RNA was extracted from frozen tissue in the Ottawa Ovarian Tissue Bank and mRNA expression was determined by quantitative, real-time, reverse-transcriptase PCR (Q-PCR). Kaplan-Meier survival curves and regression analyses were determined using Prism software. The A2780s ovarian cell line, which has high expression of both BRCA1 and ERCC1, was exposed to a number of drugs including chemotherapy and molecular inhibitors and analyzed by the MTT cell viability assay. Results: Linear regression analysis demonstrated that both low BRCA1 and ERCC1 expression were associated with improved survival ( P=0.048 and P=0.033) but only low BRCA1 correlated with a longer TTP (P=0.047 and P=0.122, respectively). Patients were classified into relative high and low mRNA expression levels for BRCA1. There was no significant difference between the two groups with respect to the distribution of independent variables, age, stage, residual disease status, grade and p53 IHC score. The median OS by Kaplan-Meier estimates for BRCA1-low was 51 months, and for BRCA1-high was 37 months, illustrating a trend that patients with decreased BRCA1 expression have a more favorable survival (P=0.079). The median TTP was 20.5 months in BRCA1-low and 12.5 months in BRCA1-high, but the distribution between groups was not significantly different in this patient cohort (P=0.384). Exposure of the A2780s cell line to a number of therapeutic agents either alone or in combination, resulted in differential drug sensitivity. Conclusions: Low BRCA1 and ERCC1 expression correlates with improved survival and may be useful to tailor chemotherapeutic approaches in the treatment of ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Cancer TherapeuticsMême sujetOvarian cancer diagnosis and treatmentTravaux en français237 207