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Enregistrement W2271189918 · doi:10.1161/strokeaha.115.011854

Peripheral Blood <i>MCEMP1</i> Gene Expression as a Biomarker for Stroke Prognosis

2016· article· en· W2271189918 sur OpenAlexaff
Kripa Raman, Martin O’Donnell, Anna Członkowska, Yan Duarte, Patricio López‐Jaramillo, Ernesto Peñaherrera, Mike Sharma, Ashkan Shoamanesh, Marta Skowrońska, Salim Yusuf, Guillaume Paré

Notice bibliographique

RevueStroke · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineStroke (engine)Modified Rankin ScaleInternal medicineCohortIntracerebral hemorrhageConfidence intervalBiomarkerOncologyIschemic strokeSubarachnoid hemorrhageIschemia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: A limitation when making early decisions on stroke management is the lack of rapid diagnostic and prognostic testing. Our study sought to identify peripheral blood RNA biomarkers associated with stroke. The secondary aims were to assess the discriminative capacity of RNA biomarkers for primary stroke type and stroke prognosis at 1-month. METHODS: Whole-blood gene expression profiling was conducted on the discovery cohort: 129 first-time stroke cases that had blood sampling within 5 days of symptom onset and 170 control participants with no history of stroke. RESULTS: Through multiple regression analysis, we determined that expression of the gene MCEMP1 had the strongest association with stroke of 11 181 genes tested. MCEMP1 increased by 2.4-fold in stroke when compared with controls (95% confidence interval, 2.0-2.8; P=8.2×10(-22)). In addition, expression was elevated in intracerebral hemorrhage when compared with ischemic stroke cases (P=3.9×10(-4)). MCEMP1 was also highest soon after symptom onset and had no association with stroke risk factors. Furthermore, MCEMP1 expression independently improved discrimination of 1-month outcome. Indeed, discrimination models for disability and mortality that included MCEMP1 expression, baseline modified Rankin Scale score, and primary stroke type improved discrimination when compared with a model without MCEMP1 (disability Net Reclassification Index, 0.76; P=3.0×10(-6) and mortality Net Reclassification Index, 1.3; P=1.1×10(-9)). Significant associations with MCEMP1 were confirmed in an independent validation cohort of 28 stroke cases and 34 controls. CONCLUSIONS: This study demonstrates that peripheral blood expression of MCEMP1 may have utility for stroke diagnosis and as a prognostic biomarker of stroke outcome at 1-month.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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