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Enregistrement W2272459943 · doi:10.1371/journal.pone.0138525

TBX1 Represses Vegfr2 Gene Expression and Enhances the Cardiac Fate of VEGFR2+ Cells

2015· article· en· W2272459943 sur OpenAlexfundno aff
Gabriella Lania, Rosa Ferrentino, Antonio Baldini

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaFondazione Telethon
Mots-clésTBX1BiologyProgenitor cellEmbryonic stem cellCell biologyTranscription factorGene expressionStem cellGenePromoterGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The T-box transcription factor TBX1 has critical roles in maintaining proliferation and inhibiting differentiation of cardiac progenitor cells of the second heart field (SHF). Haploinsufficiency of the gene that encodes it is a cause of congenital heart disease. Here, we developed an embryonic stem (ES) cell-based model in which Tbx1 expression can be modulated by tetracycline. Using this model, we found that TBX1 down regulates the expression of VEGFR2, and we confirmed this finding in vivo during embryonic development. In addition, we found a Vegfr2 domain of expression, not previously described, in the posterior SHF and this expression is extended by loss of Tbx1. VEGFR2 has been previously described as a marker of a subpopulation of cardiac progenitors. Clonal analysis of ES-derived VEGFR2+ cells indicated that 12.5% of clones expressed three markers of cardiac lineage (cardiomyocyte, smooth muscle and endothelium). However, a pulse of Tbx1 expression was sufficient to increase the percentage to 20.8%. In addition, the percentage of clones expressing markers of multiple cardiac lineages increased from 41.6% to 79.1% after Tbx1 pulse. These results suggest that TBX1 plays a role in maintaining a progenitor state in VEGFR2+ cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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