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Enregistrement W2272884499 · doi:10.1118/1.4941363

Sample size requirements for knowledge‐based treatment planning

2016· article· en· W2272884499 sur OpenAlexafffund
Justin J. Boutilier, Tim Craig, Michael B. Sharpe, Timothy C. Y. Chan

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2016
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSample size determinationStatisticsMathematicsLogistic regressionSample (material)Set (abstract data type)Linear regressionRegression analysisPrincipal component analysisFunction (biology)Computer scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To determine how training set size affects the accuracy of knowledge-based treatment planning (KBP) models. METHODS: The authors selected four models from three classes of KBP approaches, corresponding to three distinct quantities that KBP models may predict: dose-volume histogram (DVH) points, DVH curves, and objective function weights. DVH point prediction is done using the best plan from a database of similar clinical plans; DVH curve prediction employs principal component analysis and multiple linear regression; and objective function weights uses either logistic regression or K-nearest neighbors. The authors trained each KBP model using training sets of sizes n = 10, 20, 30, 50, 75, 100, 150, and 200. The authors set aside 100 randomly selected patients from their cohort of 315 prostate cancer patients from Princess Margaret Cancer Center to serve as a validation set for all experiments. For each value of n, the authors randomly selected 100 different training sets with replacement from the remaining 215 patients. Each of the 100 training sets was used to train a model for each value of n and for each KBT approach. To evaluate the models, the authors predicted the KBP endpoints for each of the 100 patients in the validation set. To estimate the minimum required sample size, the authors used statistical testing to determine if the median error for each sample size from 10 to 150 is equal to the median error for the maximum sample size of 200. RESULTS: The minimum required sample size was different for each model. The DVH point prediction method predicts two dose metrics for the bladder and two for the rectum. The authors found that more than 200 samples were required to achieve consistent model predictions for all four metrics. For DVH curve prediction, the authors found that at least 75 samples were needed to accurately predict the bladder DVH, while only 20 samples were needed to predict the rectum DVH. Finally, for objective function weight prediction, at least 10 samples were needed to train the logistic regression model, while at least 150 samples were required to train the K-nearest neighbor methodology. CONCLUSIONS: In conclusion, the minimum required sample size needed to accurately train KBP models for prostate cancer depends on the specific model and endpoint to be predicted. The authors' results may provide a lower bound for more complicated tumor sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,280
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,280
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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