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Enregistrement W2274984007 · doi:10.1200/jco.2014.32.3_suppl.225

BRM promoter insertion/deletion polymorphisms in hepatocellular carcinoma risk and survival.

2014· article· en· W2274984007 sur OpenAlexaffabout
Kit Man Wong, Geoffrey Liu, Jonghun John Lee, Osvaldo Espin‐Garcia, Yonathan Brhane, Dangxiao Cheng, Zhuo Chen, Devalben Patel, Catherine Brown, Amy Wong, David Reisman, Wei Xu, Jennifer J. Knox, Sean P. Cleary

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyHepatocellular carcinomaInternal medicineOdds ratioProportional hazards modelHazard ratioLogistic regressionConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

225 Background: MEF2D and HDAC9 regulate the expression of BRM, the catalytic subunit of SWI/SNF (chromatin remodeling complex). MEF2D binding sites are created in the BRM promoter by two germline insertion/deletion polymorphisms (BRM-741, BRM-1321), which mediate epigenetic silencing. We recently identified BRM as a potential drug target and a susceptibility gene for lung and head and neck cancers, while others reported its association with HCC risk in Asians. BRM also correlates with prognosis in lung and esophageal cancers (ASCO 2013; abstracts 11057, 4077). In this analysis, we assessed the effects of the BRM promoter variants on risk and overall survival (OS) in HCC from a North American centre (Toronto). Methods: We conducted a case-control study with 266 histologically confirmed HCC cases and 536 age/sex distribution-matched healthy controls. Survival of the cases was obtained from medical records. Association between the BRM polymorphisms and HCC risk was analyzed by multivariate logistic regression adjusted for age, sex, race, smoking and BMI; their impact on OS was evaluated by Cox proportional hazard regression adjusted for age, sex, treatment intent and Hepatitis B status. Results: Median age was 62 years; 83% were male. Hepatitis B and C infections affected 34% and 31% of cases, respectively. 83% of patients were Child Pugh A at diagnosis, and 66% received initial curative therapy (surgical resection rate 32%). There were 13% deaths at a median follow-up of 24.1 months. There was no significant association between BRM polymorphisms and HCC risk: the adjusted risk odds ratios of the homozygous BRM variants, relative to wild-type, were 0.87 (95% CI: 0.53-1.45; BRM-741) and 1.01 (95% CI: 0.78-1.29; BRM-1321), and 0.94 (95% CI: 0.48-1.86) for the double homozygotes vs. double wild-type. The adjusted hazard ratios for OS were 5.77 (95% CI: 2.9-11.5; BRM-741) and 4.09 (95% CI: 2.2-7.5; BRM-1321) for each variant allele; the double homozygotes were also highly associated with OS compared to double wild-type (p<0.0001). Conclusions: Two functional BRM promoter polymorphisms did not increase the risk of HCC. However, they were strongly associated with OS despite short median follow-up. SPC and RH are co-senior authors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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