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Enregistrement W2275131636 · doi:10.1101/031328

Surprisingly weak coordination between leaf structure and function among closely-related tomato species

2015· preprint· en· W2275131636 sur OpenAlexaff
Christopher D. Muir, Miquel À. Conesa, Emilio J. Roldán, Arántzazu Molins, Jeroni Galmés

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2015
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDivision of Integrative Organismal SystemsNational Science Foundation
Mots-clésBiologyTraitPhylogenetic treePhotosynthesisTaxonStomatal conductanceEvolutionary biologyNatural selectionEcologySelection (genetic algorithm)BotanyGeneticsGeneMachine learningComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural selection may often favor coordination between different traits, or phenotypic integration, in order to most efficiently acquire and deploy scarce resources. As leaves are the primary photosynthetic organ in plants, many have proposed that leaf physiology, biochemistry, and anatomical structure are coordinated along a functional trait spectrum from fast, resource-acquisitive syndromes to slow, resource-conservative syndromes. However, the coordination hypothesis has rarely been tested at a phylogenetic scale most relevant for understanding rapid adaptation in the recent past or predicting evolutionary trajectories in response to climate change. To that end, we used a common garden to examine genetically-based coordination between leaf traits across 19 wild and cultivated tomato taxa. We found surprisingly weak integration between photosynthetic rate, leaf structure, biochemical capacity, and CO2 diffusion, even though all were arrayed in the predicted direction along a 'fast-slow' spectrum. This suggests considerable scope for unique trait combinations to evolve in response to new environments or in crop breeding. In particular, we find that partially independent variation in stomatal and mesophyll conductance may allow a plant to improve water-use efficiency without necessarily sacrificing maximum photosynthetic rates. Our study does not imply that functional trait spectra or tradeoffs are unimportant, but that the many important axes of variation within a taxonomic group may be unique and not generalizable to other taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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