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Enregistrement W2275222991 · doi:10.3855/jidc.7094

New Delhi metallo-β-lactamase in Jamaica

2016· article· en· W2275222991 sur OpenAlexaff
Camille-Ann Thoms-Rodriguez, Tony Mazzulli, Nicole Christian, Barbara Willey, David A. Boyd, Laura Mataseje, Michael R. Mulvey, C D C Christie, Alison Nicholson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infection in Developing Countries · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity Health NetworkPublic Health Agency of CanadaMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeNew delhiMicrobiologyPulsed-field gel electrophoresisBiologyTypingPlasmidMultiplex polymerase chain reactionBacilliInfection controlIsolation (microbiology)GenotypeGenePolymerase chain reactionBacteriaMedicineEscherichia coliGeneticsIntensive care medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The global dissemination of the New Delhi metallo-beta-lactamase (NDM) gene among certain strains of bacteria has serious implications since the infections caused by such organisms pose a therapeutic challenge. Although the NDM gene has been detected in various parts of the world, this is the first report of its detection in the English-speaking Caribbean. The NDM producing Klebsiella pneumoniae was isolated from an Indian patient who had recently relocated to Jamaica. METHODOLOGY: Identification and susceptibility testing of the K. pneumoniae isolate was performed using the Vitek 2 automated system) in keeping with Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) standards. It was identified as a metallobetalactamase producer using the Rosco KPC+MBL kit. Genotypic screening for common betalactamase (including carbapenemase) genes, was carried out using two multiplex PCRs: one for SHV-, TEM-, CTX-M-, OXA-1-, and CMY-2-types, and one for VIM-, KPC-, IMP-, OXA-48, GES-, and NDM-types. Strain typing was conducted by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using XbaI and multi-locus sequencing (MLS). Plasmid isolation and analysis was also performed. RESULTS: K. pneumoniae (N11-02395), not previously associated with the dissemination of the NDM in India, Sweden or the UK, was found to harbor the NDM-1 gene on plasmid pNDM112395. CONCLUSION: The identification of the NDM-1 gene underscores the need for effective surveillance and infection control measures to identify and prevent spread of multidrug resistant Gram negative bacilli. Strict infection control measures implemented for this patient helped to prevent the spread of this organism to other patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,226

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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