Sex differences in the intestinal transcriptome and spatial patterns of lipid uptake capacity and intestinal lipid-metabolic gene expression
Notice bibliographique
Résumé
The mammalian small intestine expresses three members of the fatty acid binding protein family; Fabp1, Fabp2, and Fabp6 that differ in their spatial expression pattern and ligand binding preference. In vitro studies using recombinant FABPs suggest an important role in lipid uptake and intestinal lipid metabolism, although the in vivo functions remain unclear. Mice genetically altered to lack Fabp2 exhibit a sex-dimorphic response to high fat diet feeding featuring weight gain and fatty liver in males but not females, suggesting that Fabp2 is involved in a sex-dimorphic intestinal metabolic program. We developed a technique for the analysis of sex differences in transcriptome data and applied it to a study of the intestinal transcriptome of chow-fed Fabp2-/- mice. This analysis revealed lipid metabolic pathways that are differentially regulated in male and female Fabp2-/- mice. We next conducted a high fat diet feeding study for the purpose of analyzing the effects of Fabp2 loss on lipid uptake capacity and spatial expression patterns of lipid metabolic genes identified from the transcriptome experiment. Females lacking Fabp2 exhibited an increased capacity for lipid uptake and an increased abundance of Fabp1 mRNA in the proximal intestine. Loss of Fabp2 also caused an increased excretion of total lipids in females compared to males. This suggests that females might be protected from the adverse effects of Fabp2 loss by directing excess lipids towards excretion pathways through an intracellular, Fabp1-mediated mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».