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Enregistrement W2275904384 · doi:10.1111/jbi.12675

Joint inferences from cytoplasmic <scp>DNA</scp> and fossil data provide evidence for glacial vicariance and contrasted post‐glacial dynamics in tamarack, a transcontinental conifer

2016· article· en· W2275904384 sur OpenAlexafffundabout
Emile Warren, Guillaume de Lafontaine, Sébastien Gérardi, Sauphie Senneville, Jean Beaulieu, Martin Perron, Juan Pablo Jaramillo‐Correa, Jean Bousquet

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMinistère des Ressources naturelles et des ForêtsNatural Resources CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGlacial periodBiologyEcologyPopulationLast Glacial MaximumRange (aeronautics)VicariancePhylogeographyPaleontologyPhylogeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Tamarack ( Larix laricina ) is an early‐successional transcontinental boreal conifer occurring within the spruce‐fir dominated forest. The aim was to infer the species biogeographical history and to assess the putative genetic imprint left by interspecific competition during post‐glacial migration, using cytoplasmic DNA and fossil data. Location Forty‐five locations were sampled across the transcontinental range spanning the North American boreal forest. Methods A total of 621 trees were scanned for mitochondrial and chloroplast DNA polymorphisms to reveal geographical patterns of genetic diversity, differentiation, and population structure throughout the species range. Published pollen records were analysed to assess the chronology of post‐glacial colonization of Larix sp. relative to more competitive tree taxa, Picea sp. and Abies sp.. Results Genotyping resulted in two mitotypes (one locus) and 24 chlorotypes (three cp SSR loci). Bayesian assignment test based on cp DNA data detected three groups: eastern North America, western North America and Alaska. Cp DNA population differentiation was higher in the western part of the range relative to the eastern part. Post‐glacial colonization chronology derived from fossil data indicated that Larix colonized western North America at least 4000 years after Picea and Abies , but shortly preceded them in eastern North America. Main conclusions Cytoplasmic and fossil data provided support for four distinct glacial lineages. Two lineages would have persisted south of the Laurentide ice sheet, while the two remaining ones likely originate from northern refugia located in Beringia and Labrador. Larix establishment was possibly hindered by earlier establishment of more competitive taxa in western North America, which resulted in high genetic differentiation among western populations. These results provide support for a putative role of interspecific competition in structuring the standing genetic variation at the time of post‐glacial colonization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,267
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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