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Enregistrement W2276975798 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.618.3

Intracellular localization of TDAG51 modulates its effect on cell death

2009· article· en· W2276975798 sur OpenAlexafffund
Hiam Al‐Bayati, Jeffrey G. Dickhout, Ray Traunt, Richard C. Austin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésIntracellularNuclear localization sequenceProgrammed cell deathCell biologyCytoplasmBiologyNLSTransfectionNuclear transportCell nucleusCellApoptosisCell cultureGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our previously findings indicate that T‐cell death associated gene 51 (TDAG51) contributes to cell death in atherosclerotic lesions. To determine if these cell death effects are mediated by TDAG51 intracellular localization, we performed sequence analysis of the TDAG51 cDNA to identify novel cellular targeting domains. This analysis revealed two putative motifs; a nuclear exiting signal (NES) (70‐vasleppvkl‐80) and nuclear localization signal (NLS) (16‐krsdgllqlwkkk‐28). We hypothesized that these TDAG51 motifs play a critical role in its intracellular transport, thereby modulating its pro‐apoptotic effects. To investigate this phenomenon, VKL was mutated to AKA in NES to impair exiting of the TDAG51 protein from the nucleus to the cytoplasm and WKKK was mutated to WKAA in NLS to impair entrance of TDAG51 into the nucleus. Following transient transfection of the fused GFP constructs into HeLa cells, the cellular localization of these mutant TDAG51 proteins was assessed using confocal microscopy on fixed cells or visualized in living cells over a 2 to 48 hour time period. Our findings show that both motifs are involved in the intracellular transport of TDAG51. By determining cell viability, we were able to determine the predominant effects of nuclear TDAG51 on cell death. These studies provide a better understanding of the cellular motifs in TDAG51 that contribute to cell death. Supported by the CIHR (MOP‐74477).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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