Plasma organochlorines, interaction between the aryl hydrocarbon receptor gene and organochlorines, and risk of non-Hodgkin lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
The association between plasma organochlorine exposure and increased risk for non-Hodgkin lymphoma (NHL) has been documented, although results are not consistent. No studies have yet explored gene-environment interactions with organochlorine exposure, which may provide more insight into etiology of disease. One candidate gene to study such gene-environment interactions is the aryl hydrocarbon receptor (AHR) gene, which is involved in detoxification of organochlorines in the body. This case-control study was conducted to measure the association between plasma organochlorines and NHL risk, and how variants in the AHR gene may modify this risk. All HIV-negative NHL cases aged 20-79 were diagnosed between March 2000 and February 2004, and resided in the Greater Vancouver or Greater Victoria regions. Controls frequency matched by age, sex and region were identified from the Client Registry of the BC Ministry of Health. Demographic information was collected by telephone interview. 791 cases and 797 controls provided a DNA sample for genotyping of AHR, and seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped. Pre-chemotherapy blood samples from 422 cases and 460 controls were utilized for organochlorine measurement. Levels of 14 polychlorinated biphenyl (PCB) congeners and 11 organochlorine pesticide analytes were determined. Logistic regression was used to evaluate the association between AHR SNPs and risk of NHL, lipid-adjusted organochlorine levels and risk of NHL, and interaction between AHR SNPs and organochlorines. We found significant associations with several PCB congeners and other organochlorines. Organochlorines significantly associated with NHL include PCB congeners 99, 118, 138, 153, 156, 170, 180, and 187 as well as pesticides β-HCCH, DDE, hexachlorobenzene, mirex, oxychlordane and trans-nonachlor. The odds ratios for the highest versus lowest exposure categories for these organochlorines ranged from 1.4 to 2.7. The AHR IVS1+4640G/A SNP (rs17722841) was found to increase the risk of NHL. The odds ratio for the G/A or A/A allele compared to the G/G allele was 1.3 (95% CI=1.1-1.6). Significant interactions were also found between this allele and the organochlorines PCB 118, oxychlordane, and trans-nonachlor. For oxychlordane the odds ratio for the highest versus lowest exposure categories was 3.2 (95% CI=1.8-5.5) in the G/G genotype, but was not significant in the G/A or A/A genotypes (OR 1.3, 95%CI=0.5-3.4). The strong association observed for various PCB congeners and other organochlorines confirms the increased risk of NHL from organochlorine exposure. Results suggest the role of organochlorines in NHL etiology may involve the AHR pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».