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Enregistrement W2277986603 · doi:10.1161/str.46.suppl_1.wp417

Abstract W P417: A Common Variant in a TGFβ Modifier Locus Is Associated with Intracranial Hemorrhage Presentation of Brain Arteriovenous Malformation in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia

2015· article· en· W2277986603 sur OpenAlexaff
Ludmila Pawlikowska, Jeffrey Nelson, Diana E. Guo, Charles E. McCulloch, Michael T. Lawton, Helen Kim, Marie E. Faughnan

Notice bibliographique

RevueStroke · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVascular Anomalies and Treatments
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTelangiectasiaArteriovenous malformationACVRL1Intracerebral hemorrhageVascular malformationIntracranial Arteriovenous MalformationsInternal medicinePathologyEndoglinSubarachnoid hemorrhageSurgeryCerebral angiographyAngiographyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Hereditary hemorrhagic telangiectasia (HHT) is caused by mutations in TGFβ/BMP9 pathway genes, most commonly ENG or ALK1. HHT patients have arteriovenous malformations (AVM) in brain, lung and liver, leading to severe complications including intracranial hemorrhage (ICH) from brain AVM. ICH presentation of brain AVM in HHT is a marker of high ICH risk. The clinical heterogeneity of HHT suggests a potential role for genetic modifier effects. Common genetic variants in loci that modify phenotype severity in Tgfb knockout mice have been reported to be associated with pulmonary AVM in HHT. We sought to replicate these associations and investigate whether these variants are also associated with brain AVM and ICH presentation of brain AVM in HHT patients. Methods: We genotyped 3 variants (PTPN14 rs2936018, USH2A rs700024 and ADAM17 rs10495565) in 665 Caucasian HHT patients enrolled by the Brian Vascular Malformation Consortium (BVMC). Association of genotype with pulmonary AVM, brain AVM and ICH presentation was evaluated by multivariate logistic regression adjusted for age, gender and family clustering, and also stratified by HHT mutation (ALK1 or ENG). Results: Of 665 Caucasian HHT patients analyzed, 51% had pulmonary AVM and 20% had brain AVM, of whom 17% presented with ICH. None of the 3 SNPs was significantly associated with pulmonary or brain AVM. Among 130 brain AVM patients, USH2A rs700024 was associated with ICH presentation (OR=3.34, 95% CI=1.22-9.15, p=0.019). The effect size was similar in HHT patients with ALK1 and ENG mutations, but only reached statistical significance among the latter (OR=6.77, p=0.014). Conclusions: A common variant in USH2A, rs700024, previously reported to be associated with pulmonary AVM in HHT, was associated with ICH presentation of brain AVM, but not with brain or pulmonary AVM, in the BVMC HHT cohort. Association of the same USH2A variant with different HHT severity phenotypes in different cohorts suggests that it may act as a genetic modifier of HHT phenotype severity in concert with other genetic and environmental factors. Once validated, such genetic modifiers may improve our understanding of the phenotypic heterogeneity of HHT and aid in ICH risk prediction in HHT brain AVM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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