Quantitative Trait Loci Mapping and Candidate Gene Identification for Seed Glucosinolates in <i>Brassica rapa</i> L.
Notice bibliographique
Résumé
Glucosinolates (GSLs) are sulfur‐ and nitrogen‐rich plant secondary metabolites biosynthesized in plant species belonging to the order Brassicales. In this study, using recombinant inbred lines (RILs) developed from a cross between Chinese cabbage [Brassica rapa L. subsp. chinensis (L.) Hanelt and subsp. pekinensis (Lour.) Hanelt] and yellow sarson [B. rapa L. subsp. trilocularis (Roxb.) Hanelt], eight gene‐specific and gene‐flanking markers for GSLs and 148 simple‐sequence repeat (SSR) markers were assembled on the previous ultradense genetic map of B. rapa. Quantitative trait loci (QTL) mapping for GSLs was performed using this genetic map, and gene‐specific markers were used to identify the loci involved in the biosynthesis of GSLs. Over a dozen QTL for progoitrin, gluconapin, glucoalyssin, glucobrassicanapin, 4‐hydroxyglucobrassicin, total aliphatic glucosinolate, and total GSL were identified in seeds. A candidate locus of Br‐GSL‐ELONG gene on linkage group A03 was identified to cosegregate with 5C aliphatic GSLs (glucoalyssin, glucobrassicanapin, and sum of 5C) in B. rapa. This locus was also colocalized with the QTL controlling seed gluconapin and sum of 4C GSL (gluconapin, progoitrin). The results suggest that the Br‐GSL‐ELONG locus on linkage group A03 might have multifunctional properties for 4C and 5C aliphatic GSL biosynthesis in Brassica species. Glucosinolate biosynthesis gene‐specific molecular markers developed in this study can be used to manipulate GSLs in other Brassica species including rapeseed (B. napus L.) and Brassica vegetables.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».