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Enregistrement W2278652963 · doi:10.1021/acs.analchem.5b04904

An Ultrasensitive Light-up Cu<sup>2+</sup> Biosensor Using a New DNAzyme Cleaving a Phosphorothioate-Modified Substrate

2016· article· en· W2278652963 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and Science
Mots-clésDeoxyribozymeChemistryBiosensorCleaveMetal ions in aqueous solutionDNACleavage (geology)RNARibonucleotideDetection limitNucleic acidSubstrate (aquarium)Molecular beaconCombinatorial chemistryMetalNucleotideStereochemistryBiochemistryOligonucleotideChromatographyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cu(2+) is a very important metal ion in biology, environmental science, and industry. Developing biosensors for Cu(2+) is a key topic in analytical chemistry. DNAzyme-based sensors are highly attractive for their excellent sensitivity, stability, and programmability. In the past decade, a few Cu(2+) biosensors were reported using DNAzymes with DNA cleavage or DNA ligation activity. However, they require unstable ascorbate or imidazole activation. So far, no RNA-cleaving DNAzymes specific for Cu(2+) are known. In this work, a phosphorothioate (PS) RNA-containing library was used for in vitro selection, and a few new Cu(2+)-specific RNA-cleaving DNAzymes were isolated. Among them, a DNAzyme named PSCu10 was studied further. It has only eight nucleotides in the enzyme loop with a cleavage rate of 0.1 min(-1) in the presence of 1 μM Cu(2+) at pH 6.0 (its optimal pH). Between the two diastereomers of the PS RNA chiral center, the R(p) isomer is 37 times more active than the S(p) one. Among the other divalent metal ions, only Hg(2+) can cleave the substrate due to its extremely high thiophilicity. A catalytic beacon sensor was designed with a detection limit of 1.6 nM Cu(2+) and extremely high selectivity. PSCu10 is specific for Cu(2+), and it has no cleavage in the presence of ascorbate, which reduces Cu(2+) to Cu(+).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle