Salt stress responses in a geographically diverse collection of Eutrema/Thellungiella spp. accessions
Notice bibliographique
Résumé
Salinity strongly impairs plant growth and development. Natural genetic variation can be used to dissect complex traits such as plant salt tolerance. We used 16 accessions of the halophytic species Eutrema salsugineum (previously called Thellungiella salsuginea (Pallas) O.E.Schulz, Thellungiella halophila (C.A.Meyer) O.E. Schulz and Thellungiella botschantzevii D.A.German to investigate their natural variation in salinity tolerance. Although all accessions showed survival and growth up to 700mM NaCl in hydroponic culture, their relative salt tolerance varied considerably. All accessions accumulated the compatible solutes proline, sucrose, glucose and fructose and the polyamines putrescine and spermine. Relative salt tolerance was not correlated with the content of any of the investigated solutes. We compared the metabolomes and transcriptomes of Arabidopsis thaliana (L. Heynh.) Col-0 and E. salsugineum Yukon under control and salt stress conditions. Higher content of several metabolites in Yukon compared with Col-0 under control conditions indicated metabolic pre-adaptation to salinity in the halophyte. Most metabolic salt responses in Yukon took place at 200mM NaCl, whereas few additional changes were observed between 200 and 500mM. The opposite trend was observed for the transcriptome, with only little overlap between salt-regulated genes in the two species. In addition, only about half of the salt-regulated Yukon unigenes had orthologues in Col-0.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».