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Enregistrement W2278996712 · doi:10.1091/mbc.e15-06-0420

<i>Drosophila</i>Nedd4-long reduces Amphiphysin levels in muscles and leads to impaired T-tubule formation

2016· article· en· W2278996712 sur OpenAlexafffund
Frozan Safi, Alina Shteiman-Kotler, Yunan Zhong, Konstantin G. Iliadi, Gabrielle L. Boulianne, Daniela Rotin

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyAmphiphysinCell biologySynaptogenesisUbiquitin ligaseImmunoprecipitationUbiquitinTubulePostsynaptic potentialDrosophila melanogasterNEDD4BiochemistryEndocrinologyReceptorKidneyEndocytosisDynamin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drosophila Nedd4 (dNedd4) is a HECT ubiquitin ligase with two main splice isoforms: dNedd4-short (dNedd4S) and -long (dNedd4Lo). DNedd4Lo has a unique N-terminus containing a Pro-rich region. We previously showed that whereas dNedd4S promotes neuromuscular synaptogenesis, dNedd4Lo inhibits it and impairs larval locomotion. To delineate the cause of the impaired locomotion, we searched for binding partners to the N-terminal unique region of dNedd4Lo in larval lysates using mass spectrometry and identified Amphiphysin (dAmph). dAmph is a postsynaptic protein containing SH3-BAR domains and regulates muscle transverse tubule (T-tubule) formation in flies. We validated the interaction by coimmunoprecipitation and showed direct binding between dAmph-SH3 domain and dNedd4Lo N-terminus. Accordingly, dNedd4Lo was colocalized with dAmph postsynaptically and at muscle T-tubules. Moreover, expression of dNedd4Lo in muscle during embryonic development led to disappearance of dAmph and impaired T-tubule formation, phenocopying amph-null mutants. This effect was not seen in muscles expressing dNedd4S or a catalytically-inactive dNedd4Lo(C→A). We propose that dNedd4Lo destabilizes dAmph in muscles, leading to impaired T-tubule formation and muscle function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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