Comprehensive analysis of flagellin glycosylation in<i>Campylobacter jejuni</i>NCTC 11168 reveals incorporation of legionaminic acid and its importance for host colonization
Notice bibliographique
Résumé
Campylobacter jejuni is the leading cause of bacterial gastroenteritis. It relies on several virulence factors for host colonization, including glycosylated flagella. C. jejuni NCTC 11168 modifies its flagellins with pseudaminic acid derivatives. It is also presumed to modify these proteins with legionaminic acid, although no glycopeptide evidence was available at the onset of this study. The enzyme encoded by cj1319 can be used to make legionaminic acid in vitro, but the pathway for legionaminic acid synthesis partially inferred by knockout mutagenesis in Campylobacter coli VC167 excludes Cj1319. To address this contradiction, we examined the presence of legionaminic acid in flagellin glycopeptides of wild-type (WT) C. jejuni NCTC 11168 and of a cj1319 knockout mutant. We used high-energy collision-induced dissociation to obtain amino acid sequences while also visualizing signature sugar oxonium ions. Data analysis was performed with PEAKS software, and spectra were manually inspected for glycopeptide determination and verification. We showed that legionaminic acid is present on the flagellins of C. jejuni NCTC 11168 and that flagellin glycosylation is highly heterogeneous, with up to six different sugars singly present at a given site. We found that the cj1319 mutant produces more legionaminic acid than WT, thus excluding the requirement for Cj1319 for legionaminic acid synthesis. We also showed that this mutant has enhanced chicken colonization compared with WT, which may in part be attributed to the high content of legionaminic acid on its flagella.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».