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Enregistrement W2280166798 · doi:10.1093/ofid/ofv133.1465

Preliminary End-of-Season Estimates of 2014/15 Influenza Vaccine Effectiveness in Preventing Laboratory-Confirmed Influenza-Related Hospitalization From the Serious Outcomes Surveillance (SOS) Network of the Canadian Immunization Research Network (CIRN)

2015· article· en· W2280166798 sur OpenAlexaboutno aff
Shelly McNeil, Ardith Ambrose, Melissa K. Andrew, Guy Boivin, William Bowie, Gaël Dos Santos, May ElSherif, Karen Green, François Haguinet, Todd F. Hatchette, Kevin Katz, Jason J. LeBlanc, Mark Loeb, Donna MacKinnon‐Cameron, Anne McCarthy, Janet E. McElhaney, Allison McGeer, Jeff Powis, David Richardson, Makeda Semret, Rohita Sharma, Vivek Shinde, Daniel Smyth, Sylvie Trottier, Louis Valiquette, Duncan Webster, Lingyun Ye

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineImmunizationInfluenza seasonInfluenza vaccineVaccine-preventable diseasesVaccinationPediatricsVirologyMedical emergencyIntensive care medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Canada's 2014/15 influenza season was characterized by early, intense influenza A(H3N2) activity followed by a smaller influenza B peak. Characterization of circulating viruses demonstrated poor match with the A(H3N2) component of the 2014/15 vaccine suggesting vaccine effectiveness (VE) would be suboptimal. We provide end-of-season estimates of influenza VE for prevention of influenza-related hospitalization in adults. Methods. The SOS Network conducted active surveillance for influenza in hospitalized adults from 15 November 2014 to 30 April 2015 in 16 hospitals. A nasopharyngeal swab for influenza PCR was obtained from all adult patients admitted with acute respiratory illness. Cases were PCR-positive; those influenza-PCR negative within 7 days of symptom onset with known influenza vaccination status were controls. Crude VE estimates were adjusted using multivariable logistic regression with stepwise backward selection of covariates with a p-value of <0.1 in the univariate analysis. VE was estimated as (1 − OR) × 100. Results. 1693 cases and 1936 controls were enrolled; cases were older (mean age 76.1 versus 72.6y; p < .0001); 62.4% cases were >75y. Cases were more likely than controls to have received antivirals (AV) before admission (0.6% versus 0.1%; p = .009) and to be pregnant (1.3% versus 0.2%; p < .0005). 68.2% cases and 69.6% controls had received influenza vaccine ≥2 wks prior to symptom onset. Among all age groups, VE was −0.4% (95% CI −24.5 to 19.0%) against all strains, −32.7% (−91.2 to 7.9%) against A(H3N2) and 20.1% (−15.9 to 44.9%) against influenza B. Age, prior receipt of AV, BMI and ≥1 comorbidity were adjusted in the final regression model. In ≥ 65y, VE was −0.9% (−29.6 to 21.4%) against all strains, −36.2% (−105.9 to 9.9%) against A(H3N2) and 17.8% (−28.7 to 47.5%) against B. Conclusion. The 2014/15 season in Canada was dominated by circulation of a drifted influenza A(H3N2). Although VE cannot be predicted directly from virologic surveillance, mismatch between the circulating strain and vaccine strain this season did result in failure of the vaccine to provide protection against influenza-associated hospitalization. Influenza programs should ensure real-time VE assessment to inform adjunctive public health strategies to minimize influenza disease burden. Disclosures. S. Mcneil, GlaxoSmithKline: Grant Investigator and Investigator, Research grant; M. K. Andrew, GlaxoSmithKline: Grant Investigator, Research grant; G. Dos Santos, GSK Vaccines: Consultant, Salary; F. Haguinet, GSK Vaccines: Employee, Salary; T. Hatchette, GlaxoSmithKline: Grant Investigator, Research grant; J. Leblanc, GlaxoSmithKline: Grant Investigator, Research grant; J. E. Mcelhaney, Sanofi Pasteur: Independent Contractor, Speaker honorarium; R. Sharma, GSK Vaccines: Employee, Salary; V. Shinde, GSK Vaccines: Employee, Salary; L. Valiquette, Pfizer: Grant Investigator, Research grant. Merck: Grant Investigator, Research grant. GSK: Grant Investigator, Research grant

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,526
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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