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Enregistrement W2280436805 · doi:10.2174/1568026615666150701113344

Exploring the Technology Landscape of 7TMR Drug Signaling Profiling

2015· review· en· W2280436805 sur OpenAlexaff
Arturo Mancini, Mélanie Frauli, Billy Breton

Notice bibliographique

RevueCurrent Topics in Medicinal Chemistry · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensSNC-Lavalin (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug discoveryFunctional selectivityG protein-coupled receptorReceptorSecond messenger systemSignal transductionComputational biologyTransmembrane proteinArrestinG proteinTransmembrane domainBiologyChemistryCell biologyBioinformaticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Seven transmembrane domain receptors (7TMRs) constitute the largest family of transmembrane proteins in vertebrates and are the targets of more than 40% of currently marketed drugs. It is now accepted that these receptors are highly dynamic "microprocessors" that adopt a continuum of functionally distinct active conformations. The novel concept of biased agonism (or functional selectivity) posits that different ligands stabilize unique receptor conformations with each conformation imparting distinct signaling, and thus biological attributes, to a given receptor. The pharmacotherapeutic potential of biased agonism lies in possibility to develop molecules that selectively engage beneficial pathways while inhibiting or remaining inert towards those producing deleterious outcomes. Various strategies are now applied for the discovery of biased ligands. Many assays use second messenger levels (i.e., calcium, inositol trisphosphate, cAMP) as a quantitative readout of G-protein subtype-specific activity. However, due to complex cross-regulation between the various G-protein pathways, second messenger levels alone are not directly reflective of a ligand's activity on a specific pathway. Consequently, direct measurements of receptor-proximal events (such as G-protein activation and β-arrestin coupling) are required for a more accurate quantification of ligand's efficacy (or bias) towards different pathways. The discovery that various ligands of the same receptor can display different efficacies and potencies towards different receptor-downstream signaling pathways has not only revitalized the process of 7TMR drug discovery, but has significantly transformed the field of pharmacology as a whole. This review will showcase the current pharmacological toolbox available for the discovery and validation of biased ligands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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