MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2281165607 · doi:10.1007/s00251-016-0907-0

Patterns of MHC-DRB1 polymorphism in a post-glacial island canid, the Newfoundland red fox (Vulpes vulpes deletrix), suggest balancing selection at species and population timescales

2016· article· en· W2281165607 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueImmunogenetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary Equine Medical Research
Établissements canadiensGovernment of Newfoundland and LabradorMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMemorial University of Newfoundland
Mots-clésVulpesBiologyBalancing selectionPopulationSelection (genetic algorithm)ZoologyMajor histocompatibility complexEvolutionary biologyPolymorphism (computer science)GeneticsEcologyGenePredationGenotypeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As the only native insular Newfoundland canid between the extinction of the wolf in the 1930s and the recent arrival of coyotes, the red fox (Vulpes vulpes deletrix Bangs 1898) poses interesting questions about genetic distinctiveness and the post-glacial colonization history of the island's depauperate mammalian fauna. Here, we characterized genetic variability at the major histocompatibility complex (MHC) class II DR β1 domain (DRB1) locus in 28 red foxes from six sampling localities island-wide and compared it with mitochondrial control region (CR) diversity and DRB1 diversity in other canids. Our goals were to describe novel DRB1 alleles in a new canid population and to make inferences about the role of selection in maintaining their diversity. As in numerous studies of vertebrates, we found an order-of-magnitude higher nucleotide diversity at the DRB1 locus compared with the CR and significantly positive nonsynonymous-to-synonymous substitution ratios, indicative of selection in the distant past. Although the evidence is weaker, the Ewens-Watterson test of neutrality and the geographical distribution of variation compared with the CR suggest a role for selection over the evolutionary timescale of populations. We report the first genetic data from the DRB1 locus in the red fox and establish baseline information regarding immunogenetic variation in this island canid population which should inform continued investigations of population demography, adaptive genetic diversity, and wildlife disease in red foxes and related species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,468
Score d'incertitude au seuil0,649

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle