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Enregistrement W2281552816 · doi:10.14288/1.0088595

Clinical characteristics of 8p inversion duplication and other 8p rearrangements

2009· article· en· W2281552816 sur OpenAlexaff
Stanislava B. Jurenka

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene duplicationInversion (geology)GeologyPaleontologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main goal of the project reported in this thesis is to summarize the current knowledge of the 8p inversion duplication clinical features, to add observations of our own patients, and to correlate the resulting clinical definition with the new information on the molecular analysis of these cases. I present detailed clinical and cytogenetic findings of four patients with 8p inversion duplication, three of which were previously unreported. Two of these patients had an atypical inverted chromosome. In this atypical variant the center of symmetry was found to be more distal on the 8p arm of chromosome 8 so that the portion of 8p23.2 was duplicated in addition to more proximal bands. The report of our two patients is the first focused on this variant. The secondary goal of this thesis was to determine if these variants could be distinguished from the common form in order to add to our knowledge regarding the critical region responsible for the abnormal phenotype in this group of patients. After a detailed clinical comparison of the two types of 8p inversion duplication, I found that in one of the patients with the atypical variant, the physical features were not clearly different from the common type, although the developmental deficit was less marked. In the second patient with the atypical variant the developmental delay and dysmorphism were minimal. In this case the duplication was short, terminating in 8p21.3 band. This case might point to the more exact location of the critical region on 8p. A cosmid 153G8, containing repetitive sequences hybridizing to 4p and to 8p, was used as FISH probe in four cases of 8p inversion duplication. In cases A. and B., 153G8 hybridized to the center of symmetry at 8p23.1. In cases C. and D. with the center of symmetry at 8p(23.2), two FISH signals flanked the center of symmetry. This finding provides the evidence that that repetitive sequences are present in the 8p23.1 region, and that in the atypical variant, the center of symmetry is distal to 8p23.1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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