MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2282472979 · doi:10.12688/f1000research.7842.1

Profiling and tandem mass spectrometry analysis of aminoacylated phospholipids in Bacillus subtilis 

2016· preprint· en· W2282472979 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSaskatchewan Health Research FoundationUniversity of Saskatchewan
Mots-clésPhosphatidylglycerolCardiolipinBacillus subtilisBiochemistryPhosphatidylethanolaminePhospholipidChemistryBiologyTandem mass spectrometryMass spectrometryBacteriaPhosphatidylcholineChromatographyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cationic modulation of the dominantly negative electrostatic structure of phospholipids plays an important role in bacterial response to changes in the environment. In addition to zwitterionic phosphatidylethanolamine, Gram-positive bacteria are also abundant in positively charged lysyl-phosphatidylglycerol. Increased amounts of both types of lipids render Gram-positive bacterial cells more resistant to cationic antibiotic peptides such as defensins. Lysyl and alanyl-phosphatidylglycerol as well as alanyl-cardiolipin have also been studied by mass spectroscopy. Phospholipids modified by other amino acids have been discovered by chemical analysis of the lipid lysate but have yet to be studied by mass spectroscopy. We exploited the high sensitivity of modern mass spectroscopy in searching for substructures in complex mixtures to establish a sensitive and thorough screen for aminoacylated phospholipids. The search for deprotonated aminoacyl anions in lipid extracted from Bacillus subtilis strain 168 yielded strong evidence as well as relative abundance of aminoacyl-phosphatidylglycerols, which serves as a crude measure of the specificity of aminoacyl-phosphatidylglycerol synthase MprF. No aminoacyl-cardiolipin was found. More importantly, the second most abundant species in this category is D-alanyl-phosphatidylglycerol, suggesting a possible role in the D-alanylation pathway of wall- and lipo-teichoic acids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle